Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PIK3CAP42336 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms