Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BRCA1P38398 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BRCA1P38398 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA1P38398 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA1P38398 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA1P38398 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA1P38398 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA1P38398 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA1P38398 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA1P38398 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA1P38398 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA1P38398 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BRCA1P38398 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms