Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FDFT1P37268 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FDFT1P37268 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms