Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARGP37231 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARGP37231 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARGP37231 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PPARGP37231 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PPARGP37231 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PPARGP37231 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PPARGP37231 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPARGP37231 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPARGP37231 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPARGP37231 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPARGP37231 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPARGP37231 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPARGP37231 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPARGP37231 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPARGP37231 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPARGP37231 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPARGP37231 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPARGP37231 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPARGP37231 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPARGP37231 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPARGP37231 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPARGP37231 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPARGP37231 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPARGP37231 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PPARGP37231 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PPARGP37231 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PPARGP37231 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms