Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
POLR2IP36954 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
POLR2IP36954 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms