Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ABCC1P33527 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ABCC1P33527 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ABCC1P33527 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms