Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CASQ1P31415 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CASQ1P31415 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CASQ1P31415 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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