Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AC015987.1-201ENST00000419211 804 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 TTR-204ENST00000610404 1040 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 QRSL1P3-201ENST00000552666 1316 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AC092106.1-201ENST00000444291 373 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AC073987.1-201ENST00000422683 638 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 LINC01284-201ENST00000442994 730 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AC092164.1-203ENST00000444501 723 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 GCNT7-202ENST00000617620 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 MKRN1-211ENST00000480552 906 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 ZNF528-AS1-204ENST00000601562 1069 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 BX255923.1-201ENST00000613309 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXD11P31277 OR5AR1-201ENST00000624596 1026 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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