Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA7P31268 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA7P31268 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms