Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CMPK1P30085 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CMPK1P30085 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms