Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD40LGP29965 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms