Protein–RNA interactions for Protein: P29475

NOS1, Nitric oxide synthase, brain, humanhuman

Predictions only

Length 1,434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOS1P29475 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NOS1P29475 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOS1P29475 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOS1P29475 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOS1P29475 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOS1P29475 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOS1P29475 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOS1P29475 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOS1P29475 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOS1P29475 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOS1P29475 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOS1P29475 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOS1P29475 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOS1P29475 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NOS1P29475 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOS1P29475 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NOS1P29475 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NOS1P29475 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOS1P29475 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOS1P29475 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOS1P29475 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOS1P29475 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NOS1P29475 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOS1P29475 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOS1P29475 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NOS1P29475 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOS1P29475 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOS1P29475 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOS1P29475 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOS1P29475 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOS1P29475 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOS1P29475 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOS1P29475 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOS1P29475 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOS1P29475 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOS1P29475 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOS1P29475 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NOS1P29475 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOS1P29475 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NOS1P29475 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOS1P29475 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOS1P29475 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOS1P29475 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOS1P29475 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOS1P29475 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOS1P29475 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOS1P29475 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOS1P29475 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOS1P29475 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOS1P29475 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOS1P29475 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOS1P29475 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOS1P29475 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOS1P29475 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOS1P29475 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NOS1P29475 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NOS1P29475 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOS1P29475 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOS1P29475 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOS1P29475 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOS1P29475 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOS1P29475 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOS1P29475 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOS1P29475 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOS1P29475 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOS1P29475 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOS1P29475 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NOS1P29475 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOS1P29475 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOS1P29475 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOS1P29475 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOS1P29475 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOS1P29475 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOS1P29475 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NOS1P29475 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOS1P29475 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOS1P29475 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOS1P29475 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOS1P29475 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOS1P29475 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NOS1P29475 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NOS1P29475 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NOS1P29475 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NOS1P29475 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NOS1P29475 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
NOS1P29475 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NOS1P29475 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NOS1P29475 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NOS1P29475 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOS1P29475 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOS1P29475 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NOS1P29475 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOS1P29475 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOS1P29475 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOS1P29475 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOS1P29475 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOS1P29475 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOS1P29475 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOS1P29475 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOS1P29475 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms