Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMO2P25791 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO2P25791 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO2P25791 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO2P25791 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO2P25791 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO2P25791 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO2P25791 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO2P25791 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO2P25791 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO2P25791 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO2P25791 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO2P25791 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO2P25791 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO2P25791 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO2P25791 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO2P25791 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO2P25791 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LMO2P25791 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMO2P25791 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMO2P25791 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LMO2P25791 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LMO2P25791 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LMO2P25791 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LMO2P25791 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LMO2P25791 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms