Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPREP23469 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPREP23469 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPREP23469 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPREP23469 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPREP23469 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPREP23469 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPREP23469 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPREP23469 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPREP23469 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPREP23469 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPREP23469 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPREP23469 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPREP23469 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPREP23469 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPREP23469 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPREP23469 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPREP23469 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPREP23469 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPREP23469 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPREP23469 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPREP23469 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPREP23469 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPREP23469 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPREP23469 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPREP23469 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPREP23469 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPREP23469 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPREP23469 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPREP23469 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPREP23469 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPREP23469 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPREP23469 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPREP23469 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPREP23469 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPREP23469 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPREP23469 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPREP23469 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPREP23469 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPREP23469 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPREP23469 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPREP23469 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPREP23469 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPREP23469 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPREP23469 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPREP23469 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPREP23469 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPREP23469 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPREP23469 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPREP23469 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPREP23469 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms