Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGS1P23219 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms