Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LBPP18428 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LBPP18428 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LBPP18428 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LBPP18428 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LBPP18428 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LBPP18428 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LBPP18428 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LBPP18428 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LBPP18428 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LBPP18428 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LBPP18428 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LBPP18428 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LBPP18428 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LBPP18428 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LBPP18428 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LBPP18428 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LBPP18428 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LBPP18428 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LBPP18428 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LBPP18428 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LBPP18428 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LBPP18428 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LBPP18428 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LBPP18428 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LBPP18428 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms