Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCG2P13521 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG2P13521 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG2P13521 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG2P13521 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG2P13521 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG2P13521 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG2P13521 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG2P13521 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG2P13521 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG2P13521 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG2P13521 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG2P13521 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG2P13521 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG2P13521 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG2P13521 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG2P13521 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG2P13521 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG2P13521 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG2P13521 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SCG2P13521 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCG2P13521 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCG2P13521 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG2P13521 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG2P13521 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG2P13521 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG2P13521 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG2P13521 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG2P13521 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG2P13521 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG2P13521 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCG2P13521 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms