Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LYL1P12980 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LYL1P12980 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LYL1P12980 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LYL1P12980 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LYL1P12980 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms