Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VPREB1P12018 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms