Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ODC1P11926 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ODC1P11926 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODC1P11926 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODC1P11926 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODC1P11926 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODC1P11926 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODC1P11926 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODC1P11926 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODC1P11926 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODC1P11926 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODC1P11926 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODC1P11926 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODC1P11926 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODC1P11926 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODC1P11926 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ODC1P11926 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODC1P11926 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODC1P11926 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODC1P11926 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODC1P11926 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODC1P11926 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ODC1P11926 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODC1P11926 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODC1P11926 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ODC1P11926 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ODC1P11926 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODC1P11926 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODC1P11926 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ODC1P11926 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms