Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
TOP2AP11388 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC34.92■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
TOP2AP11388 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms