Protein–RNA interactions for Protein: P11142

HSPA8, Heat shock cognate 71 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA8P11142 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA8P11142 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA8P11142 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms