Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RD3LP0DJH9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms