Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC175P0C221 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC175P0C221 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms