Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJB1P08034 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB1P08034 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB1P08034 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB1P08034 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB1P08034 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB1P08034 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB1P08034 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB1P08034 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB1P08034 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB1P08034 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB1P08034 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB1P08034 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB1P08034 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB1P08034 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB1P08034 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJB1P08034 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB1P08034 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB1P08034 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB1P08034 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB1P08034 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB1P08034 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB1P08034 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB1P08034 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB1P08034 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB1P08034 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB1P08034 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB1P08034 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB1P08034 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJB1P08034 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GJB1P08034 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJB1P08034 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJB1P08034 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB1P08034 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB1P08034 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms