Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNTO95613 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNTO95613 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNTO95613 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNTO95613 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCNTO95613 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PCNTO95613 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNTO95613 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNTO95613 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNTO95613 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNTO95613 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNTO95613 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNTO95613 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNTO95613 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNTO95613 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNTO95613 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNTO95613 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNTO95613 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNTO95613 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNTO95613 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNTO95613 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNTO95613 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCNTO95613 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNTO95613 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNTO95613 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNTO95613 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNTO95613 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNTO95613 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNTO95613 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNTO95613 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNTO95613 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNTO95613 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNTO95613 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNTO95613 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNTO95613 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNTO95613 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNTO95613 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNTO95613 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNTO95613 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNTO95613 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNTO95613 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCNTO95613 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNTO95613 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNTO95613 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNTO95613 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNTO95613 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNTO95613 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNTO95613 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNTO95613 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNTO95613 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNTO95613 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNTO95613 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCNTO95613 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCNTO95613 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNTO95613 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNTO95613 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNTO95613 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNTO95613 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNTO95613 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNTO95613 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNTO95613 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNTO95613 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNTO95613 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNTO95613 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNTO95613 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNTO95613 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNTO95613 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNTO95613 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNTO95613 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNTO95613 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCNTO95613 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNTO95613 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNTO95613 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCNTO95613 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms