Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX4O95219 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX4O95219 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX4O95219 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX4O95219 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX4O95219 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX4O95219 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX4O95219 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX4O95219 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX4O95219 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX4O95219 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX4O95219 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX4O95219 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX4O95219 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX4O95219 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX4O95219 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX4O95219 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX4O95219 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX4O95219 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX4O95219 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX4O95219 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX4O95219 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX4O95219 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX4O95219 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX4O95219 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX4O95219 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX4O95219 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX4O95219 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX4O95219 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNX4O95219 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms