Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM2O94769 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM2O94769 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM2O94769 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM2O94769 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM2O94769 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM2O94769 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM2O94769 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM2O94769 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ECM2O94769 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ECM2O94769 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECM2O94769 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECM2O94769 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ECM2O94769 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM2O94769 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM2O94769 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM2O94769 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM2O94769 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM2O94769 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM2O94769 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM2O94769 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM2O94769 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM2O94769 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM2O94769 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM2O94769 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ECM2O94769 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM2O94769 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM2O94769 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM2O94769 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM2O94769 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM2O94769 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM2O94769 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM2O94769 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM2O94769 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM2O94769 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM2O94769 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM2O94769 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM2O94769 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ECM2O94769 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ECM2O94769 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ECM2O94769 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms