Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F6O75461 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F6O75461 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F6O75461 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F6O75461 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F6O75461 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F6O75461 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F6O75461 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F6O75461 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F6O75461 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F6O75461 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F6O75461 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F6O75461 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F6O75461 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F6O75461 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F6O75461 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F6O75461 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F6O75461 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F6O75461 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F6O75461 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F6O75461 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F6O75461 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F6O75461 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F6O75461 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms