Protein–RNA interactions for Protein: O75446

SAP30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30O75446 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAP30O75446 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAP30O75446 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAP30O75446 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SAP30O75446 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms