Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
ZNF253O75346 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ZNF253O75346 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms