Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIA4O75335 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms