Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG13O75143 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ATG13O75143 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG13O75143 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG13O75143 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG13O75143 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG13O75143 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG13O75143 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG13O75143 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG13O75143 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG13O75143 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG13O75143 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG13O75143 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG13O75143 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG13O75143 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG13O75143 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG13O75143 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ATG13O75143 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG13O75143 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG13O75143 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG13O75143 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG13O75143 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG13O75143 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG13O75143 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG13O75143 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG13O75143 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG13O75143 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG13O75143 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG13O75143 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG13O75143 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG13O75143 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG13O75143 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG13O75143 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ATG13O75143 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG13O75143 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG13O75143 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG13O75143 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG13O75143 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG13O75143 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG13O75143 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG13O75143 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG13O75143 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG13O75143 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG13O75143 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG13O75143 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG13O75143 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG13O75143 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG13O75143 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG13O75143 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG13O75143 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG13O75143 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG13O75143 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ATG13O75143 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ATG13O75143 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ATG13O75143 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ATG13O75143 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG13O75143 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG13O75143 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ATG13O75143 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms