Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF3O75054 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGSF3O75054 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms