Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIN3BO60391 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIN3BO60391 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms