Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMARCA5O60264 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms