Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDE6DO43924 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms