Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO3O43524 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO3O43524 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO3O43524 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO3O43524 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO3O43524 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO3O43524 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO3O43524 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO3O43524 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO3O43524 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO3O43524 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO3O43524 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO3O43524 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO3O43524 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO3O43524 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXO3O43524 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOXO3O43524 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOXO3O43524 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FOXO3O43524 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXO3O43524 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms