Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMD3O43242 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms