Protein–RNA interactions for Protein: O15438

ABCC3, Canalicular multispecific organic anion transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC3O15438 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ABCC3O15438 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ABCC3O15438 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ABCC3O15438 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms