Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LAMA5O15230 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LAMA5O15230 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms