Protein–RNA interactions for Protein: O15066

KIF3B, Kinesin-like protein KIF3B, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3BO15066 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIF3BO15066 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIF3BO15066 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms