Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SETD1AO15047 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SETD1AO15047 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms