Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms