Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NOTOA8MTQ0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NOTOA8MTQ0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms