Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC169A6NNP5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC169A6NNP5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms