Protein–RNA interactions for Protein: A6NLX3

SPDYE4, Speedy protein E4, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYE4A6NLX3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPDYE4A6NLX3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPDYE4A6NLX3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms