Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCHNA4D1U4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LCHNA4D1U4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LCHNA4D1U4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms