Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
A4D1N5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
A4D1N5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
A4D1N5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
A4D1N5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
A4D1N5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
A4D1N5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
A4D1N5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
A4D1N5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
A4D1N5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms