Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms